ISSN 2075-3594 (Print)
ISSN 2414-9322 (Online)

Biological significance of differentially expressed genes in hypoxic-ischemic acute kidney

S.V. Popov, R.G. Guseinov, A.M. Yesayan, O.N. Skryabin, A.V. Vasin, A.V. Kovalevskaya, V.V. Perepelitsa, A.Kh. Beshtoev, T.A. Lelyavina

1) St. Luke's Clinical Hospital, St. Petersburg, Russia; 2) S. M. Kirov Military Medical Academy, St. Petersburg, Russia; 3) St. Petersburg State University, St. Petersburg, Russia; 4) Smorodintsev Research Institute of Influenza, St. Petersburg, Russia; 5) Pavlov University, St. Petersburg, Russia; 6) St. Petersburg Medical and Social Institute, St. Petersburg, Russia; 7) Peter the Great St. Petersburg Polytechnic University, Institute of Biomedical Systems and Biotechnologies, St. Petersburg, Russia; 8) Almazov National Medical Research Center, St. Petersburg, Russia
Evaluation of the causes and mechanisms of acute kidney injury (AKI) is an urgent task of modern urology, as it leads to a better understanding of the pathology and facilitates the search for effective therapeutic strategies.
Material and methods. This article analyzes literature sources on the significance of biomarkers with proven changes in the expression level in AKI.
Results. The diversity of pathogenetic mechanisms determines the participation of many genes in the cascade of pathological reactions that lead to AKI. Genetic profiling aimed at searching for genetic determinants of AKI will provide early identification of patients at risk and personalized preventive measures in accordance with the modern model of patient-centered medicine.
Conclusion. To date, however, genetic variants of biomarkers of kidney damage and their relationship with susceptibility to AKI have not been determined, and diagnostic panels of expression of genetic biomarkers of kidney damage are not used in routine clinical practice.

Keywords

acute kidney injury
biomarkers
gene expression
gene polymorphism

Введение

Острое повреждение почек (ОПП) − распространенное состояние, которое встречается у 5,0–7,5% госпитализированных пациентов и у 50–60% пациентов в критическом состоянии, являясь независимым фактором высокого риска смертности [1–3]. В настоящее время стандартными критериями диагностики ОПП служат нарастание уровня сывороточного креатинина и/или снижение диуреза в течение фиксированного периода времени [4]. Однако эти индикаторы обладают ограниченной чувствительностью и специфичностью в отношении ОПП, а также отсроченно реагируют на почечное повреждение, поэтому не могут считаться ранним маркером повреждения почек [5]. Ввиду этого в настоящее время пристальное внимание уделяется поиску ранних диагностических биомаркеров ОПП, уровень которых увеличивается еще до повышения уровня креатинина в сыворотке [6–8].

Профилактика развития и прогрессирования ОПП на сегодняшний день ограничивается оптимизацией гемодинамики и водного статуса пациентов из группы риска, а также предупреждением воздействия нефротоксинов [4, 9]. Следует отметить, что ОПП является потенциально обратимым состоянием, поскольку эпителий почечных канальцев обладает высокой способностью к регенерации. Однако поиск специфического фармакологического лечения ОПП затруднен поздней диагностикой, сложной и не до конца выясненной патофизиологией этого состояния [2]. По мнению ряда авторов, ОПП представляет собой гетерогенный синдром с различной этиологией и патофизиологией, обусловленный разнообразными клеточными и молекулярными событиями, без изучения которых затруднено понимание заболевания и, соответственно, поиск эффективных терапевтических стратегий [10–12].

Основными патогенетическими звеньями ОПП являются ишемия, гипоксия, повышение уровня провоспалительных цитокинов и воспаление, активация системы комплемента, лейкоцитарная инфильтрация, снижение уровня аденозинтрифосфата, повышенная генерация активных форм кислорода, дисфункция эндотелия, нарушение микроциркуляции, которые в итоге приводят к повреждению структур нефрона [13, 14]. Известно, что состояние гипоксии и ишемии увеличивает транскрипцию ряда генов [15, 16]. В связи с этим одним из способов изучения какого-либо патологического состояния является поиск генов, уровень экспрессии которых меняется при наличии этого состояния по сравнению с нормой. Предполагается, что генетические факторы обусловливают разную восприимчивость к повреждающим почки факторам, тяжесть течения ОПП и ответ на лечение у разных пациентов [17, 18]. При этом гены, уровень транскрипционной активности которых меняется в тканях при патологии, могут быть вовлечены в патогенез заболевания путем изменения качества своего участия в функциональных процессах или работе сигнальных путей [19]. Многообразие патогенетических механизмов ОПП позволяет предположить существенную вариабельность генетических факторов, отвечающих за тяжесть течения и исход заболевания. Таким образом, изучение молекулярных маркеров ОПП является актуальной задачей современной урологии.

Цель исследования − изучить значимость биомаркеров, уровень экспрессии которых повышается при ОПП гипоксически-ишемического генеза.

Материал и методы

Проведен поиск литературных источников в базах PubMed, Scopus, Springer, Elibrary на русском и английском языках с использованием терминов «острое почечное повреждение», «биомаркеры», «экспрессия генов», «полиморфизм генов» («acute kidney injury», «biomarkers», «gene expression», «gene polymorphism»). В обзор были включены ретроспективные, проспективные, аналитические, описательные исследования, клинические рекомендации, систематические обзоры, мета-анализы по анализируемой теме. Не рассматривались тезисы конференций, описания клинических случаев, диссертационные работы, письма в редакцию журналов. С учетом небольшого числа публикаций в доступных источниках по теме исследования глубина поиска была с 1993 по 2023 г. В итоге в настоящий обзор включены 62 публикации.

Результаты

К белкам, экспрессия которых повышается при ОПП, относятся липокалин, связанный с желатиназой нейтрофилов (NGAL – Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, LCN2 – липокалин-2), молекула почечного повреждения почек-1 (KIM-1 – kidney injury molecule), печеночный протеин, связывающий жирные кислоты (L-FABP – Liver-type fatty acid binding protein), интерлейкин-18 [4]. При остром ишемически-реперфузионном повреждении почечной ткани экспрессия генов этих белков в клетках почечных канальцев существенно возрастает, что приводит в течение последующих 6–12 часов к резкому возрастанию их синтеза с многократным увеличением выделения с мочой еще до повышения уровня креатинина в крови [20].

NGAL кодируется геном, расположенным в хромосомном локусе 9q34, и представляет собой белок массой 25 кДа, принадлежащий к суперсемейству липокалинов. Ген NGAL на постоянно низком уровне экпрессирован в нейтрофилах, клетках проксимальных и дистальных почечных канальцев, печени, трахее, легких и других тканях. В физиологических условиях белок циркулирует в плазме крови в небольшой концентрации и определяется в моче в следовых количествах. При ОПП происходит быстрое многократное увеличение синтеза матричной РНК (мРНК), кодирующей NGAL, в клетках проксимальных канальцев и дистальных сегментах нефрона, что приводит к возрастанию синтеза белка уже через 3–6 часов после повреждения почек и повышению его мочевой экскреции. Следует отметить, что при ОПП уровень NGAL в плазме крови возрастает в 7–16 (сывороточный NGAL, sNGAL), а в моче – в 25–1000 раз (NGAL мочи – uNGAL). Кроме того, повышение экскреции NGAL с мочой возникает на 24–48 часов раньше, чем повышение концентрации сывороточного креатинина. Таким образом, sNGAL и uNGAL на сегодняшний день признаны ранними биомаркерами ОПП [21].

В экспериментальном исследовании J. Mishra и соавт. (2003) в модели ишемически-реперфузионного повреждения почек у мышей и крыс выраженное (более чем в 10 раз) повышение уровня мРНК и белка NGAL в моче наблюдалось в раннем постишемическом периоде (через 2 часа после повреждения), коррелировало с выраженностью и продолжительностью ишемии почек и предшествовало появлению других мочевых маркеров, таких как N-ацетил-β-D-глюкозаминидаза и β2-микроглобулин [22].

В работе B. Woodson и соавт. (2013) у крыс отмечалась повышенная экспрессия uNGAL уже через 30 минут после пережатия сосудов ворот почки и сохранялась через 15 и 60 минут [23]. У пациентов после нефрэктомии и резекции почки по поводу рака исследование в динамике уровня NGAL мочи позволяет выявлять ОПП уже через 2 часа, при этом максимальные значения уровня биомаркера отмечаются через 8 часов после хирургического вмешательства [24].

В мета-анализе данных 19 исследований, включивших более 2500 пациентов, было обнаружено, что уровни NGAL в сыворотке и моче не только являются ранними диагностическими биомаркерами ОПП, но и способны предсказывать клинические исходы (чем выше уровень NGAL, тем тяжелее ОПП), необходимость в диализной терапии и смертность пациентов [25].

В исследовании Y. Jiang и соавт. (2022) показано, что уровень sNGAL был значительно повышен у беременных женщин с артериальной гипертензией (АГ) с ОПП и положительно коррелировал с уровнями креатинина сыворотки, азота мочевины, мочевой кислоты, систолическим и диастолическим артериальным давлением, а также с уровнями белка в суточной моче [26].

Известно, что ОПП является достаточно частым осложнением кардиохирургических вмешательств в условиях искусственного кровообращения [27]. В зависимости от исходных характеристик и типа хирургического вмешательства частота ОПП в этих случаях составляет до 39%, причем от 1,0 до 6,5% пациентов нуждаются в заместительной почечной терапии [28]. Ввиду этого пристальное внимание уделяется поиску ранних предикторов острого нарушения функции почек у больных данной категории. Исследования свидетельствуют, что уровень NGAL является чувствительным предиктором развития ОПП после хирургического вмешательства с применением аппарата искусственного кровообращения, а также после проведения коронарографии и, следовательно, его следует учитывать в моделях прогнозирования ОПП после операции на сердце.

Например, M. Bennett и соавт. (2008) обнаружили, что уровень NGAL в моче после операции в условиях искусственного кровообращения увеличивался в 15 раз через 2 часа и до 25 раз через 4–6 часов, а также коррелировал с тяжестью и прогнозом ОПП [29].

Позднее M.G. Friedrich и соавт. (2017) изучили связь экспрессии NGAL в моче пациентов, перенесших кардиохирургическое вмешательство в условиях искусственного кровообращения, с послеоперационной функцией почек [30]. Экспрессия NGAL в моче достоверно увеличилась через 120 минут пребывания пациента на аппарате искусственного кровообращения, а также через 15 минут и 4 часа после него по сравнению с исходным уровнем. Однако корреляции между экспрессией NGAL и тяжестью ОПП авторами исследования не было выявлено.

В недавнем исследовании B. Zhang и соавт. (2023) изучили периоперационные уровни экспрессии KIM-1, NGAL и гемоксигеназы-1 (HO-1) у 80 пациентов через 12, 24 и 48 часов после замены сердечного клапана в условиях искусственного кровообращения [31]. Послеоперационный уровень NGAL у пациентов как с ОПП, так и без него был статистически значимо выше, чем до операции, причем у пациентов с диагностированным ОПП был повышен более существенно.

По данным E. Kidher и соавт. (2014), через 3 часа после искусственного кровообращения уровень sNGAL оказался гораздо более сильным предиктором ОПП и необходимости раннего медицинского вмешательства, чем сывороточный креатинин [32]. Так, уровень sNGAL выше 150 нг/мл через 3 часа после искусственного кровообращения значимо коррелировал с ОПП (r=0,68; p<0,001), а уровень выше 136 нг/мл − с необходимостью раннего медицинского вмешательства (r=0,64; p<0,001).

KIM-1 представляет собой гликопротеин клеточной мембраны I типа массой 104 кДа и является ранним чувствительным диагностическим индикатором ОПП [33, 34]. В 1998 г. в экспериментальном исследовании на крысах был выделен ген Kim-1 (CD365), который оказался полным гомологом HAVcr-1 (hepatitis A virus cellular receptor 1) [35]. В геноме человека HAVcr-1 (Gene ID: 26762) расположен на длинном плече 5-й хромосомы в локусе 5q33.3 и содержит 11 экзонов. В норме ген KIM-1 экспрессируется во многих органах и тканях человека, но уровень его экспрессии низкий, в то время как в почечной ткани содержание транскриптов HAVcr-1 в десятки раз выше [36]. При этом в апикальных клетках проксимальных канальцев здоровых почек мРНК и белок KIM-1 экспрессируются на низком уровне, однако их концентрация резко возрастает в постишемической почечной ткани и, соответственно, в моче и в циркулирующей крови.

Исследования свидетельствуют, что концентрация KIM-1 в моче возрастает спустя 6 часов после ОПП и быстро увеличивается в течение ближайших 24 часов, включаясь в механизм, защищающий почки от острого повреждения [37, 38]. Предполагается, что KIM-1 играет важную роль в восстановлении морфологической целостности почечной ткани и функции постишемической почки, отражая уровень ее репарации [39].

P.L. Zhang и соавт. (2008) показали, что уровень KIM-1 чувствительно и специфично выявляет повреждение проксимальных канальцев и коррелирует со степенью почечной дисфункции [40]. В частности, экспрессия KIM-1 значительно коррелировала с уровнями сывороточного креатинина и азота мочевины крови и была обратно пропорциональна расчетной скорости клубочковой фильтрации в день биопсии почки. Авторы сделали вывод, что экспрессия KIM-1 более чувствительна, чем гистологическое исследование, относительно выявления раннего повреждения почечных канальцев и ее уровень экспрессии в биоптатах трансплантатов отражает возможность восстановления функции почек.

W.K. Han и соавт. (2002) продемонстрировали выраженную экспрессию KIM-1 в биоптатах почек 6 пациентов с острым тубулярным некрозом и обнаружили повышенные уровни KIM-1 в моче в течение 12 часов после ишемического повреждения почек до появления цилиндров в моче [41]. Более того, данная работа показала, что повышенный уровень KIM-1 был связан с более чем 12-кратным повышением риска развития острого тубулярного некроза.

На сегодняшний день в исследованиях доказано, что уровень KIM-1 в моче и плазме крови коррелирует с выраженностью поражения почек различной этиологии [33], в т.ч. лекарственно-индуцированной нефротоксичности [42, 43]. Кроме того, уровень KIM-1 в моче наряду с концентрацией NGAL может служить инструментом прогнозирования острых осложнений после трансплантации почки, способствуя повышению выживаемости трансплантата [44].

По данным мета-анализа 11 исследований с включением 2979 пациентов, чувствительность KIM-1 в моче для диагностики ОПП составляет 74,0% (95% доверительный интервал [ДИ]: 61,0–84,0%), специфичность − 86,0% (95% ДИ: 74,0–93,0%) [45].

Вместе с тем B.D. Humphreys и соавт. (2013) выявили, что длительная экспрессия KIM-1 в клетках проксимальных канальцев трансгенных мышей вызывает хроническое воспаление и интерстициальный фиброз почечной ткани, который сопровождается протеинурией, анемией, гиперфосфатемией, АГ и гипертрофией сердца − симптомами, характерными для гипертензивной нефропатии [46].

Белки, связывающие жирные кислоты (FABP – fatty acid binding protein), представляют собой небольшие (15 кДа) цитоплазматические белки, обильно экспрессирующиеся во всех тканях с активным метаболизмом жирных кислот. В почках человека идентифицировано два типа FABP: FABP печеночного типа (L-FABP) в проксимальных канальцах и FABP сердечного типа (H-FABP) в дистальных канальцах. Свободные жирные кислоты в проксимальных канальцах связываются с цитоплазматическими FABP и транспортируются в митохондрии или пероксисомы, где метаболизируются путем β-окисления [47]. L-FABP специфически экспрессирован в цитоплазме клеток проксимальных канальцев почек, а ген FABP1 локализован на коротком плече p 2-й хромосомы человека.

В экспериментальных исследованиях установлено, что L-FABP гиперэкспрессируется в почечных канальцах и экскреция его с мочой возрастает при различных ситуациях, связанных с тубулоинтерстициальным повреждением: массивная протеинурия, диабетическая нефропатия, АГ, ишемическое или токсическое повреждение почек [48, 49]. Выделение L-FABP с мочой возрастает спустя 8 часов после ишемического повреждения и значимо коррелирует со степенью тубулоинтерстициального повреждения почечной ткани [50, 51]. Вместе с тем в исследовании M. Yanishi и соавт. (2022) увеличение экскреции L-FABP с мочой отмечалось уже в течение первых 6 часов после введения цисплатина пациентам и предшествовало повышению сывороточного креатинина более чем на 2 дня [52]. L-FABP играет существенную роль в развитии окислительного стресса и служит эффективным цитопротектором, направленным на уменьшение негативного действия свободных радикалов. Так, в экспериментальной работе D. Ichikawa (2014) при введении ангиотензина-II параллельно с увеличением мочевой экскреции L-FABP происходило уменьшение оксидативного стресса и тубулоинтерстициального повреждения [53]. Степень экспрессии L-FABP в почках и его уровни в моче увеличивались при активации ренин-ангиотензиновой системы и в совокупности со снижением уровня ангиотензина-I приводили к ослаблению тубулоинтерстициального процесса. Схожие данные получены в эксперименте на мышах K. Osaki и соавт. (2013), которые выявили, что сверэкспрессия L-FABP в проксимальных канальцах может предупреждать развитие солечувствительной АГ, индуцированной ангиотензином-II, путем ослабления активации внутрипочечной ренин-ангиотензиновой системы, снижения выработки активных форм кислорода и уменьшения тубулоинтерстициального воспаления [54].

Уровень L-FABP повышается при некрозе почечных канальцев различной этиологии: сепсисе, введении нефротоксичных препаратов, у пациентов после операций на сердце [55, 56]. При этом у пациентов с ОПП на фоне сепсиса четко прослеживалась связь между повышением экспрессии L-FABP и уровнем смертности.

Е.М. Франциянц и соавт. (2017) на основании собственных исследований предлагают использовать уровень L-FABP в качестве прогностического маркера повреждения почечной паренхимы в раннем послеоперационном периоде у больных, перенесших тепловую ишемию при резекции почки по поводу рака. Авторы рекомендуют при предоперационном уровне L-FABP 40 нг/мл и выше выполнять органосохраняющую операцию на почке длительностью не более 15 минут [57].

В недавнем проспективном исследовании с участием 82 пациентов P.G. Karakaş и соавт. (2022) убедительно показали, что L-FABP наряду с NGAL является эффективным биомаркером для раннего выявления ОПП, а также для прогнозирования клинической тяжести заболевания и необходимости проведения гемодиализа [58].

Интерлейкин-18 (ИЛ-18). Развитие воспаления является важным звеном патогенеза ОПП. В связи с этим много-обещающим представляется изучение полиморфизма генов провоспалительных цитокинов, которые отвечают за течение воспалительной реакции. Одним из наиболее важных провоспалительных генов, экспрессия которого увеличивается при ОПП, является ген, кодирующий цитокин ИЛ-18.

ИЛ-18 представляет собой цитокин, который был идентифицирован как фактор, индуцирующий интерферон-γ (ИФН-γ) в печени мышей, получавших Propionibacterium Acnes и липополисахарид [59]. ИЛ-18 вырабатывается макрофагами и другими клетками организма. Форма-предшественник ИЛ-18 массой 24 кДа расщепляется ИЛ-1β-превращающим ферментом с образованием зрелого белка ИЛ-18 массой 18 кДа. Имеются данные, что на уровень ИЛ-18 оказывают влияние полиморфизмы промотора гена этого цитокина − rs1946518 и rs187238 [60].

ИЛ-18 опосредует развитие острого тубулярного некроза почек [61]. Было показано, что уровень мРНК ИЛ-18 в почках значительно повышается в ранние сроки после ишемически-реперфузионного повреждения почек на фоне воспалительного/аутоиммунного нефрита, при введении цисплатина при отторжении почечного аллотрансплантата [62].

Систематический обзор и мета-анализ 11 исследований, охвативший 2796 пациентов из трех странах, показал высокую значимость ИЛ-18 в качестве биомаркера для раннего (менее 12 часов после повреждения) прогнозирования ОПП [61]. Установлено, что уровень ИЛ-18 в моче более 100 пг/мл свидетельствует о развитии ОПП, причем концентрация этого цитокина повышается на 48–72 часа раньше, чем возрастает уровень креатинина сыворотки крови [8].

Заключение

Современной концепцией здравоохранения является персонализированная (пациент-ориентированная) медицина, нацеленная на лечение пациентов с учетом их индивидуальных особенностей. Реализовать эту идею позволяет изучение генетического профиля пациентов и определение индивидуальных рисков. Многообразие патогенетических механизмов обусловливает участие множества генов в каскаде патологических реакций, которые приводят к ОПП. Прогнозирование развития ОПП на основе раннего выявления биомаркеров почечного повреждения предоставляет возможность для выбора оптимальной превентивной тактики. Однако на сегодняшний день генетические варианты биомаркеров почечного повреждения и их связь с предрасположенностью к ОПП не определены, а диагностические панели экспрессионных генетических маркеров ОПП в рутинной клинической практике не применяются, что может служить предметом дальнейших исследований в этой области.

About the Authors

Sergey V. Popov – Dr.Sci. (Med.), Professor, Chief Physician of St. Luke's Clinical Hospital, Head of the Center for Endoscopic Urology and New Technologies, Professor at the Department of Urology, S.M. Kirov Military Medical Academy. Address: 46 Chugunnaya st., St. Petersburg, 194044; tel.: +7 (812) 576-11-08;
e-mail: doc.popov@gmail.com. ORCID: 0000-0003-2767-7153.
Ruslan G. Guseinov – Cand.Sci. (Med.), Deputy Chief Physician for Scientific Activities, St. Luke's Clinical Hospital, Teaching Assistant at the Department of Hospital Surgery, St. Petersburg State University. Address: 46 Chugunnaya st., St. Petersburg, 194044; tel.: +7 (812) 576-11-08; e-mail: rusfa@yandex.ru. ORCID: 0000-0001-9935-0243.
Ashot M. Yesayan – Dr.Sci. (Med.), Professor, Head of the Department of Nephrology and Dialysis, Faculty of Postgraduate Education, Pavlov University, Chief External Expert in Nephrology of the North-Western Federal District of the Russian Federation. Address: 17 L.Tolstoy st. St. Petersburg, 197022; tel.: +7 (812) 338-69-20;
e-mail: essaian.ashot@gmail.com. ORCID: 0000-0002-7202-3151.
Oleg N. Skryabin – Dr.Sci. (Med.), Professor, Chief Oncologist of St. Luke's Clinical Hospital, Scientific Director of the Center for Endoscopic Urology and New Technologies. Address: 46 Chugunnaya st., St. Petersburg, 194044; tel.: +7 (812) 576-11-08; e-mail: skryabin_55@mail.com.ORCID: 0000-0002-6664-2861. 0000-0003-4064-5033.
Andrey V. Vasin – Director of the Institute of Biomedical Systems and Biotechnologies, Peter the Great St. Petersburg Polytechnic University, Doctor of Biological Sciences, Associate Professor, Professor of the Russian Academy of Sciences. Address: 11 Khlopin st., St. Petersburg, 194021; tel.: +7 (812) 290-95-00;
e-mail: vasin_av@spbstu.ru. ORCID: 0000-0002-1391-7139.
Anastasia V. Kovalevskaya – Nephrologist, St. Luke’s Clinical Hospital. Address: 46 Chugunnaya st., St. Petersburg, 194044; tel.: +7 (812) 576-11-08;
e-mail: stenia1407@mail.ru. ORCID: 0009-0004-9544-7944.
Vitaly V. Perepelitsa – Cand.Sci. (Med.), Urologist, St. Luke’s Clinical Hospital. Address: 46 Chugunnaya st., St. Petersburg, 194044; tel.: +7 (812) 576-11-08;
e-mail: perepelitsa_vit@mail.ru. ORCID: 0000-0002-7656-4473.
Akhmed Kh. Beshtoev – Research Intern, St. Luke's Clinical Hospital. Address: 46 Chugunnaya st., St. Petersburg, 194044; tel.: +7 (812) 576-11-08;
e-mail: akhmed.beshtoev@gmail.com.
Tatyana A. Lelyavina – Leading Researcher at the Institute of Electronic Experiments, Almazov NMRC, Researcher at St. Luke's Clinical Hospital.
Address: 46 Chugunnaya st., St. Petersburg, 194044; tel.: +7 (891) 908-90-18; e-mail: tatianalelyavina@mail.com. ORCID: 0000-0001-6796-4064.

Similar Articles